عمل فمتولیزیک نسبت به لیزیک معمولی که میکروکراتوم نام دارد دارای مزایای بسیاری است و به این دلیل است که جهانیان پذیرای این روش جراحی چشم هستند. اما به هر حال همه روش های جراحی دارای مزایا و معایبی هستند.
1. تصحیح کمتر از حد، تصحیح بیشتر از حد و کاهش بهترین دید .
2. تصحیح کمتر از حد هنگامی ایجاد می شود که بافت کافی برای اصلاح کامل دید برداشته نشود.
3. تصحیح بیشتر از حد زمانی رخ می دهد که بافت بیشتری برداشته شود .
4. این عمل را می توان با عمل جراحی مجدد اصلاح نمود. اما تصحیح بیش از حد با عمل جراحی مجدد مشکل تر است .
5. دیدن هاله یا اعوجاج در کنار تصاویر در چند ماه اول شایع است اما این عوارض به ندرت در فعالیت های معمول ایجاد مشکل می کند.
6. در بیمار امکان ایجاد نزدیک بینی در شب و نیاز به عینک وجود دارد.
7. خشکی چشم بعد از عمل لیزیک ممکن است ایجاد شود و به قطره اشک مصنوعی برای تسکین موقت نیاز داشته باشد .
8. درد و ناراحتی در عمل جراحی لیزیک اغلب محدود به 6 تا 24 ساعت اول پس از عمل است و به راحتی با مسکن ها رفع می شود. در این مدت ممکن است چشم به صورت موقت به نور خورشید حساس شود .
* این مشکلات بین یک تا سه ماه به تدریج از بین می روند .